Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Colgalt2Q6NVG7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Colgalt2Q6NVG7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms