Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HelbQ6NVF4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HelbQ6NVF4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HelbQ6NVF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms