Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctnna3Q65CL1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnna3Q65CL1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnna3Q65CL1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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