Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Top2bQ64511 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Top2bQ64511 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Top2bQ64511 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms