Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Surf4Q64310 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Surf4Q64310 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Surf4Q64310 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms