Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pan3Q640Q5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pan3Q640Q5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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