Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itga3Q62470 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itga3Q62470 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itga3Q62470 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms