Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nptx1Q62443 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nptx1Q62443 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms