Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Kdm5dQ62240 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm5dQ62240 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Kdm5dQ62240 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms