Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn9aQ62205 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn9aQ62205 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn9aQ62205 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms