Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf123Q5XPI3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms