Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp20Q5XG71 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp20Q5XG71 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms