Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r195Q5SVD6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r195Q5SVD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms