Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I9

Trav2, T cell receptor alpha variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav2Q5R1I9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav2Q5R1I9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav2Q5R1I9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms