Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r209Q5NC97 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r209Q5NC97 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms