Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
1810065E05RikQ5NC41 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
1810065E05RikQ5NC41 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms