Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp28Q5I043 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp28Q5I043 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms