Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Taf3Q5HZG4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf3Q5HZG4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf3Q5HZG4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf3Q5HZG4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf3Q5HZG4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Taf3Q5HZG4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Taf3Q5HZG4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Taf3Q5HZG4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms