Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl5Q5DTT4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl5Q5DTT4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms