Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Znf608Q56A10 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Znf608Q56A10 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms