Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc84Q4VA36 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc84Q4VA36 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms