Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Fam220aQ3ZN08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Fam220aQ3ZN08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Fam220aQ3ZN08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Fam220aQ3ZN08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam220aQ3ZN08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Fam220aQ3ZN08 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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