Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc43Q3V0L5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc43Q3V0L5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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