Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rimbp3Q3V0F0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rimbp3Q3V0F0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms