Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
B3gnt6Q3USF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B3gnt6Q3USF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms