Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mindy4Q3UQI9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mindy4Q3UQI9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mindy4Q3UQI9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms