Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp3Q3ULW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp3Q3ULW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms