Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3b2Q3UJB0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms