Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtcl1Q3UHU5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtcl1Q3UHU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms