Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip13Q3UA06 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trip13Q3UA06 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms