Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hbq1bQ3U0A6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hbq1bQ3U0A6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hbq1bQ3U0A6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms