Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
InipQ3TXT3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
InipQ3TXT3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms