Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd1Q3TXS7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd1Q3TXS7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd1Q3TXS7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms