Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mfsd2bQ3T9M1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mfsd2bQ3T9M1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms