Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm1123Q1RME4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms