Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc162pQ0VG85 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc162pQ0VG85 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 448.4 ms