Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shisal1Q0VBP7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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