Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem52bQ0VBF2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem52bQ0VBF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms