Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrioQ0KL02 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrioQ0KL02 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrioQ0KL02 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms