Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NeblQ0II04 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NeblQ0II04 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NeblQ0II04 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms