Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col9a2Q07643 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col9a2Q07643 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col9a2Q07643 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms