Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NrepQ07475 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms