Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AmbpQ07456 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
AmbpQ07456 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmbpQ07456 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms