Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gdf3Q07104 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms