Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bp2Q06649 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp2Q06649 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms