Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atf4Q06507 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atf4Q06507 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms