Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoc2Q05020 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc2Q05020 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms