Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox10Q04888 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox10Q04888 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms