Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox8Q04886 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox8Q04886 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms