Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx1Q04742 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Emx1Q04742 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms